FATELA nació como una iniciativa de las iglesias nacionales de la Alianza Cristiana y Misionera en Colombia, Ecuador, Perú y Estados Unidos en el año 1997, con el ánimo de capacitar a nivel de Maestría a pastores, misioneros y maestros de la iglesia, dando un nuevo nivel practico-teológico al ministerio cristiano en la región. Se inició con un formato de estudios semipresencial, innovador para su época, en las ciudades de Cali (Colombia), Lima (Peru) y Quito (Ecuador). Pero unos pocos años después llegó a Buenos Aires (Argentina), Santiago de Chile (Chile) y Sao Paulo (Brasil). Actualmente tiene centros en 12 ciudades de America y Europa, más un programa en formato virtual con estudiantes en 3 continentes.